Целями Государственного бюджетного учреждения Калининградской области "Балтберегозащита" являются выполнение функций заказчика-застройщика по проектированию и строительству, ремонту и текущему содержанию берегозащитных и других гидротехнических сооружений, берегоукреплению, обобщение и анализ материалов комплексных береговых и прибрежно-морских исследований, разработка рекомендаций оптимальной берегозащиты и природоохранного освоения Калининградского побережья Балтийского моря, Куршского и Калининградского заливов в пределах Калининградской области.