В 1919 году в поселке Парфино была построена начальная школа, которая стала предшественницей Парфинской средней муниципальной школы. В 1938 году распахнула свои двери новая средняя школа. Это было кирпичное двухэтажное здание, на берегу реки Ловать. В здании школы №1 в годы войны располагался военный госпиталь.
В 1944 году здание школы было восстановлено. До 1949 года в нем располагался детский дом для 163 сирот, потерявших родителей в годы войны. 1949 год стал первым послевоенным учебным годом в здании школы № 1. В связи с увеличением количества учащихся, возникла необходимость пристройки к основному зданию школы №1, которая и была сделана в 1975 году. Пристройка представляла собой семь классных комнат и спортивный зал. В этот период времени количество учащихся превысило 500 человек, работало 6 групп продленного дня. Преподавательский коллектив состоял из 30 учителей.
В 1984 году Парфинские школы №1 и №3 объединились. Но учеников было много, поэтому в здании Парфинской средней школы №3 решено было оставить начальную школу, которая просуществовала два года.
С 1993 года рождаемость стала падать, количество учащихся снижалось и в 1999 году произошло объединение Парфинской средней и Парфинской основной школ. Учителя вместе с учениками перешли в эту школу, где многие и работают по сей день.
С 1 сентября 2001 года коррекционная школа и вечерняя школа вошли в состав МОУ СОШ п.Парфино.
Для реализации образовательного процесса в школе оборудовано 61 кабинет, в том числе специализированные классы для проведения уроков физики, химии, биологии, технологии. Кабинеты оснащены всем необходимым оборудованием и средствами для проведения занятий, созданы условия, способствующие укреплению здоровья обучающихся посредством физической культуры и спорта. Имеются два спортивных зала, уличная многофункциональная спортивная площадка, беговая дорожка.