Министерство экономического развития Республики Алтай осуществляет реализацию государственной политики и нормативно-правовое регулирование в сфере социально-экономического развития республики, стратегического планирования, предпринимательской деятельности, торговой деятельности, внешнеэкономической деятельности, инвестиционной деятельности и деятельности социальных инвесторов, промышленной политики, имущественных и земельных отношений, разработки и реализации государственных программ Республики Алтай, мобилизационной подготовки экономики региона, регулирования контрактной системы в сфере закупок товаров, работ, услуг для обеспечения государственных нужд Республики Алтай, государственно-частного партнерства, функции по контролю и надзору, по оказанию государственных услуг, правоприменительные и иные функции в установленной сфере деятельности.