Емельяненко родился в 1976 году в городе Рубежное, Луганской области в семье Владимира Александровича, сварщика, и Ольги Фёдоровны, преподавателя ПТУ[16]. У Емельяненко есть старшая сестра Марина (р. 1974) и младшие братья — Александр (р. 1981) и Иван (р. 1988), оба выступающие в ММА[17]. В 1978 году семья Емельяненко переехала в Старый Оскол, в Белгородской области, где Фёдор оставался жить и тренироваться, даже будучи знаменитым спортсменом. Жили Емельяненко всей семьей в коммунальной квартире, занимая комнату, изначально предназначавшуюся для сушки белья, и разделяя с соседями кухню и ванную.
В 10 лет Емельяненко начал заниматься самбо и дзюдо. Любопытно, что с собой на тренировки Фёдор начал приводить младшего брата, Александра, которого не с кем было оставить дома, в результате чего Александр сам стал профессиональным атлетом и одно время входил в десятку лучших тяжеловесов мира[18]. Фёдор непрерывно продолжал занятия и после школы, во время обучения в городском ПТУ № 22, которое