Автомобиль начали выпускать в 1987 году. Первоначально автомобиль оснащался рядными четырёхцилиндровыми восьмиклапанными карбюраторными бензиновыми двигателями объёмом 1100, 1300 и 1500 куб.см.В 1991 году был разработан новый дизайн «передка» машины. Автомобили с таким передним оформлением начали выпускать сразу после начала выпуска седана ВАЗ-21099. С 1994 года на эти машины также стали устанавливаться 4-цилиндровые 8-клапанные бензиновые двигатели ВАЗ-2111 1500 куб.см., в которых применялась инжекторная система подачи топлива с распределенным впрыском топлива.
На протяжении выпуска ВАЗ 2109 было выпущено несколько модификаций:
ВАЗ-2109 — базовая модель, карбюраторный двигатель 1,3 литра (1987—1997 гг.
ВАЗ-21091 — модификация с карбюраторным двигателем 1,1 литра (1987—1997 гг.)
ВАЗ-21093 — модификация с карбюраторным двигателем 1,5 литра (1988—2006)
ВАЗ-21093i — модификация с инжекторным двигателем 1,5 литра (опытное производство с 1994, постоянное — с ноября 1998)