В былые времена армия змей состоящая из пяти кланов правила Ниндягоу . Змеи правили жестоко и беспощадно , остановить их было не возможно . И когда надеется было не на что появился первый ниндзя : зелёный ниндзя . Он одолел змей и освободил Ниндзягоу . Змеи были отправлены в изгнание и заточены в пяти пещерах , чтобы пять племен не объединились и не завладели Ниндзягоу . После того как зло было побеждено зелёный ниндзя исчез . Выпустить змей мог только зелёный ниндзя или любой змей из клана , но так как змеи не могли выбраться из пещер , то выпустить их мог только зелёный ниндзя . Но он исчез после того как змеи были повержены . Есть легенда , что зло вернется но зелёный ниндзя вновь одолеет змей . Но теперь ему не удастся победить пять объединенных кланов . Зло восстало из под земель , и теперь ниндзя нужно объединится , чтобы победить змей