Институт создан 29 декабря 1993 Постановлением Кабинета Министров Украины № 1069 как Днепропетровский филиал Института государственного управления и самоуправления при Кабинете Министров Украины. 30 мая 1995 Указом Президента Украины № 398/95 он реорганизован в Днепропетровский филиал Украинской Академии государственного управления при Президенте Украины, а 21 сентября 2001 Указом Президента Украины № 850/2001 переименован в Днепропетровский региональный институт государственного управления Национальной академии государственного управления при Президенту Украины.
Со дня основания и до сих пор институт неизменно возглавляет заслуженный деятель науки и техники Украины, доктор наук государственного управления, профессор Серегин Сергей Михайлович.