Чорноострівський професійний аграрний ліцей заснований 29 червня 1963 року, як училище Механізації сільського господарства №16. Його першим директором Був Регуш В.В.
З 1966 року в училищі розпочалась підготовка майстрів наладчиків машинно – тракторного парку. Навчання розпочалось 15 листопада 1966 року. Набір складав 52 учні. Термін навчання 6 місяців.
З 1 вересня 1967 року в училищі відкрили групи по підготовці слюсарів по ремонту тракторів, автомобілів та сільськогосподарської техніки з 1,5 річним терміном навчання. Також у цьому році розпочалась підготовка трактористів-машиністів широкого профілю з терміном навчання 2 роки.
У 1970 році Чорноострівське училище механізації сільського господарства №16 було переіменовано в Чорно острівське сільське професійно технічне училище №9.
З 19 квітня 1972 року в училищі проводилась підготовка кіномеханіків ІІ категорії з 1 річним терміном навчання. Перший випуск кіномеханіків відбувся 31 березня 1973 року в кількості 30 чоловік.
У 1974 році з 1 вересня в Чорноострівському СПТУ №9 була запроваджена середня освіта. На навчання приймалися учні після закінчення 8 класу. Навчання проводилося по спеціальності: тракторист – машиніст широкого профілю. Перший набір груп із здобуттям середньої освіти складав 171 учень.
З 2 січня 1975 року в училищі проводилась курсова трьох – місячна перепідготовка механізаторів для роботи на тракторах Т-150 та Т-150К.
З 1 вересня 1979 року в училищі розпочалась підготовка фахівців по спеціальності: лаборант хіміко – бактеріологічного аналізу, обліковець молока на тваринницьких фермах.
У 1984 році Чорноострівське СПТУ №9 було переіменоване у Чорноострівське середнє професійно технічне училище №39.
З 1 вересня 1992 року в училищі розпочалась підготовка учнів по спеціальності: Майстер сільського господарства – Кухар.
З 2003 року ведеться підготовка по спеціальності – Кухар.
З 2006 року в ліцеї ведеться підготовка по спеціальності: Оператор комп’ютерного набору; обліковець (реєстрація бухгалтерських даних).
За 50 років роботи Чорноострівського професійно – технічного навчального закладу в його стінах було підготовлено:
Трактористів машиністів 3 класу – 2680 чоловік;
Трактористів машиністів широкого профілю – 3946 чоловік;
Трактористів машиністів с/г виробництва; слюсар – ремонтник водій автотранспортних засобів категорії «С» - 4858 чоловік;
Лаборантів хіміко – бактеріологічного аналізу – 792 чоловіки;
Кухарів – 490 чоловік;
Курсова підготовка – 238 чоловік.