История библиотеки Нижегородской государственной медицинской академии, как и история самой академии, связана с Нижегородским государственным университетом им.Н.И.Лобачевского. С 1920 года по 1930 год в ННГУ существовал медицинский факультет, на основе которого был организован медицинский институт.
Приказом директора медицинского института от 14.06.1932 года двое сотрудников были зачислены в штат библиотеки, а небольшой первоначальный фонд получен из библиотеки ННГУ. Эта дата и считается датой основания библиотеки при Нижегородском медицинском институте.
До создания библиотеки на кафедрах имелись свои книжные фонды. Так, на кафедре морфологии на 01.06.1933 года насчитывалось 700 экземпляров книг; рабфак обеспечивал учебниками и учебными пособиями свои филиалы в Ижевске, Муроме, Чебоксарах и других городах. Эти фонды постепенно передавались в библиотеку. В 1934 году терапевтической клиникой были переданы в фонд библиотеки дореволюционные диссертации по медицине. В 1937 году были переданы книги и диссертации с кафедр биологии, физиологии, глазных болезней и других.
Комплектование стало осуществляться по плану в соответствии со сметой института. Источниками комплектования были библиотечный коллектор, обменные фонды библиотек Москвы и Ленинграда, частные собрания врачей города (проф. А.Л.Шабадаш, асс.А.Г.Веселицкого, А.М.Дурново и др.), литература, полученная в дар (от проф. В.Н.Виноградова и др.). С 1935 года библиотека стала получать обязательный платный экземпляр.
Фонд активно увеличивался и на 01.01.1940 года составил 53308 экземпляров. В 1947 году было получено 4000 экземпляров книг и журналов трофейной медицинской литературы на немецком языке.
Многие годы библиотека являлась отраслевым депозитарием Волго-Вятского региона, что позволило сформировать уникальную коллекцию «Фонд ценных и редких изданий», содержащую раритеты отечественной медицины: прижизненные издания Н.И.Мечникова, С.П.Боткина, Н.Ф.Филатова, И.Н.Сеченова, медицинские и иностранные журналы XVШ-XIX веков.
С 1932 по 1938 годы библиотека занимала небольшую комнату в главном здании института, а в 1938 году переехала в здание студенческого общежития №1 на улице Дзержинского (Алексеевской), д.1.
С 1951 года библиотека находилась в небольшом отдельном здании на улице Грузинской, д.22.
В 1964 году в биофизическом корпусе (БФК) была выделена площадь для абонемента учебной литературы, где он находится по настоящее время.
В 1968 году при общежитии № 4 (ул. Медицинская, д.3а) открыт читальный зал для студентов. Позднее цокольный и первый этажи общежития № 4 площадью 1200 кв.м были перепланированы для размещения библиотеки. Переехав сюда с улицы Грузинской в 1996 году, библиотека получила возможность разместить основной фонд, отделы в соответствии с нормативами и приступить к автоматизации библиотечно-информационных процессов.